Mehmed Baždarević termine sa carrière en 1998.
Il devient dans la foulée, entraineur de l'équipe réserve de Sochaux jusqu'en 2003.
En parallèle, Mehmed obtient ses diplômes
d’entraîneur professionnel de football 3ème degré, et finit même
Major de sa promotion.
Puis il va à Istres où il réussit à faire monter l'équipe en
ligue 1.
Mecha part en 2005 pour
l'Étoile du Sahel , un club Tunisien, il réussit à être finaliste
de la ligue des champions.
En 2006, Mecha part au Qatar à
Al Wakrah Club jusqu'en 2007.
Puis en 2007, il va à Grenoble où dès la première année il accède à la ligue 1.
Mehmed Baždarević est limogé en septembre 2010, (c'est
Yvon Pouliquen qui lui succède).
En 2011, Mehmed part pour Sochaux afin de succéder à
Francis Gillot, l'aventure se termine en mars 2012 alors que son équipe pointe à la dernière place de la ligue 1, afin de tenter un électrochoc le club de Sochaux nomme Bernard Genghini pour le remplacer .
Mehmed Baždarević revient au Qatar en 2012 afin d'entraîner Al-Wakrah Sports Club, il ne va y rester qu'une seule saison.
Mehmed devient sélectionneur national de la Bosnie-Herzégovine en décembre 2014, l'aventure s’arrête le 17 novembre 2014.
En juin 2018, Mehmed prend le poste d’entraîneur au Paris Football Club.
L'aventure va se terminer en décembre 2019.
Mehmed rebondit en août 2020 avec un contact d'entraineur dans le club de Guingamp.